166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1184 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  708    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0635608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  32.48 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37 
 
 		 685 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1756 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.73 
 
 		 926 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  28.49 
 
 		 1223 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  29.25 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  27.52 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  35.96 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  37.25 
 
 		 693 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1231 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  25 
 
 		 1821 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  35.79 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  31.18 
 
 		 4630 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.77 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 920 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.17 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  27.89 
 
 		 1226 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  33.64 
 
 		 935 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.36 
 
 		 1328 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  30.91 
 
 		 1174 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  29.73 
 
 		 921 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  31.58 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  34.78 
 
 		 820 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.04 
 
 		 2313 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.74 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  29.36 
 
 		 1081 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  35.35 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  29.57 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  34.88 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  30.14 
 
 		 625 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  27.91 
 
 		 807 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  28.57 
 
 		 1710 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 1321 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  28.18 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  26.03 
 
 		 857 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  28.97 
 
 		 629 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  32.43 
 
 		 758 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.91 
 
 		 471 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  31 
 
 		 710 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  34 
 
 		 1208 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  26.21 
 
 		 932 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  31 
 
 		 578 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  28.38 
 
 		 518 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  28.83 
 
 		 510 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  28.83 
 
 		 510 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 1234 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  28.83 
 
 		 510 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  28.83 
 
 		 492 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  32.95 
 
 		 218 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  28.83 
 
 		 492 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  30 
 
 		 578 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  30.39 
 
 		 624 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  24.05 
 
 		 548 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1194 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  34.86 
 
 		 692 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1226  S-layer protein, putative  28.83 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  30 
 
 		 577 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  30 
 
 		 578 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  30 
 
 		 578 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  30 
 
 		 577 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  30.97 
 
 		 754 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  28.42 
 
 		 688 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  32 
 
 		 586 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1284  putative S-layer protein  28.83 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0896591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  28.83 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.24 
 
 		 995 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  28.95 
 
 		 526 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  28.7 
 
 		 577 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  28.7 
 
 		 577 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  31.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  28.18 
 
 		 492 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.53 
 
 		 1054 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.12 
 
 		 1009 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  28.3 
 
 		 282 aa  49.7  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  29.79 
 
 		 552 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  25.22 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4531  S-layer region-like  23.73 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  25.89 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  27.21 
 
 		 530 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1049  S-layer protein  27.03 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1179  S-layer domain protein  24.79 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1129  S-layer protein  27.03 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.401991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0748  hypothetical protein  32.38 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4160  S-layer domain protein  24.79 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  33.78 
 
 		 657 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2782  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  40.38 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000207909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1225  S-layer protein, putative  26.8 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  32.38 
 
 		 935 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  26.79 
 
 		 578 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  29.79 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1207  putative S-layer protein  27.03 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.341169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2384  S-layer-like domain-containing protein  30.61 
 
 		 189 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  29.46 
 
 		 814 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  30.53 
 
 		 627 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  30 
 
 		 914 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  29.46 
 
 		 814 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  32.14 
 
 		 819 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  29.41 
 
 		 618 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>