90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1102 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  44.3 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  36.47 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  46.97 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  43.59 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  31.11 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  32.5 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.83 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  39.36 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  33.75 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  38.67 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  33.77 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  40.24 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  32.1 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  33.66 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  29.55 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  38.55 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  57.14 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  38.55 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  30.61 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  46.55 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  37.5 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  31 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1422  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.747879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  27.38 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  37.31 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  37.7 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4035  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  27.63 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  32.98 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  27.91 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  36.23 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  27.17 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0603  hypothetical protein  34.74 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  24.42 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  27.5 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 152 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  36.25 
 
 		 132 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  33.77 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  32.1 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  28.92 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  30.26 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.49 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  34.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  44.26 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  32.14 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.71 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  34.04 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  32 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>