More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4731 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 444 aa  872    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  68.97 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0810  homoserine dehydrogenase  68.6 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0112934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  57.14 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  55.71 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  54.15 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  50.82 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  51.04 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  54.33 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  48.05 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  49.65 
 
 		 428 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  49.41 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  49.88 
 
 		 428 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  48.26 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  48.49 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  47.13 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  47 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  49.07 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  48.16 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  49.43 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  48.6 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  47 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1922  homoserine dehydrogenase  48.86 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  49.66 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  49.09 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  48.86 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  45.98 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  49.18 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  47.14 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  46.45 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  47.14 
 
 		 440 aa  353  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  47.94 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  48.05 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  49.62 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  46.56 
 
 		 440 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  47.96 
 
 		 448 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  46.91 
 
 		 440 aa  343  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  46.32 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  47.26 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  47.14 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  47.34 
 
 		 439 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  45.18 
 
 		 436 aa  336  5e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 443 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  44.21 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  48.47 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 436 aa  332  7.000000000000001e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  47.64 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  43.75 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  43.59 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  43.49 
 
 		 442 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  41.45 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  43.74 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  42.37 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  43.72 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.13 
 
 		 439 aa  325  7e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  43.12 
 
 		 434 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44.28 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  43.59 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  43.26 
 
 		 442 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  44 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  44.29 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  48.62 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  42.09 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  48.12 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  48.37 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  46.31 
 
 		 438 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.53 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  45.12 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  45.32 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  44.52 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  45.08 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.93 
 
 		 432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 438 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>