105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2102 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  100 
 
 		 309 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  59.42 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  36.89 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  34.86 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  34.86 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  34.86 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  35.74 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  39.09 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  33.23 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  34.18 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  42.99 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  33.12 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  36.69 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  34.58 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  31.42 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  33.44 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  35.17 
 
 		 270 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  30.94 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  34.28 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  31.1 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  30.3 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  28.8 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  31.23 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  29.05 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  41.78 
 
 		 273 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  29.97 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  38.84 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  29.24 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  37.1 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  31.13 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.87 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.87 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  38.5 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  28.66 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  29.7 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  30.72 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  31.79 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  34.8 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  28.28 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  33.94 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  27.93 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  27.93 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  26.78 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  28.29 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  27.38 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  26.78 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  29.58 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  28.85 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  27.37 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  28.85 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  28.85 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  28.85 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  26.78 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  26.93 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  29.14 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  27.25 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  27.33 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  29.14 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  27.53 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  27.76 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  27.12 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  27.61 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  27.22 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  26.7 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  24.7 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  36.36 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  25.43 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  28 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  26.73 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.35 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.64 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  28.67 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.39 
 
 		 219 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  35.11 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  38.16 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  27.44 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  26.67 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.92 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.06 
 
 		 223 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  32.3 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  25.23 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.43 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  29.09 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.67 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  29.87 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  29.34 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  25.24 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  25.64 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  30.65 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  28.02 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  28.02 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  28.02 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  28.02 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  25.93 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>