48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  42.86 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  39.34 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  32.34 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  38.86 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  36.18 
 
 		 268 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  36.45 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  37.57 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  37.13 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  34.62 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  33.87 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  29.71 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  32.8 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  32.1 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  30.56 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  33.58 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  30.39 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  37.86 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  36.57 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  26.04 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  30.43 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  28.5 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  34.43 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  39.42 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  29.66 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  33.83 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  28.87 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  30.73 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  29.71 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  29.66 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  29.66 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  27.89 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  31.94 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  22.44 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  40.98 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  31.46 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  27.89 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  30.39 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  31.3 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  25.5 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  28.26 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2702  hypothetical protein  33.85 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291877  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  32.73 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2666  hypothetical protein  30.66 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.768262  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  26.5 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>