More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 336 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  58.75 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  48.88 
 
 		 388 aa  291  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  49.83 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  49.68 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  50.49 
 
 		 454 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  53.02 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  50.79 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  51.2 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  49.49 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  51.54 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  49.49 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  49.49 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  47.91 
 
 		 442 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  49.49 
 
 		 315 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  50.71 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  47.04 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  45.22 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  49.27 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  42.21 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  45.42 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  49.28 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  40.53 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  36 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  43.29 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  38.06 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  38.72 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 528 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 528 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.48 
 
 		 537 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  38.84 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  39.45 
 
 		 335 aa  165  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  41.58 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 550 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  35.31 
 
 		 275 aa  159  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  37.28 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 538 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  38.5 
 
 		 568 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  56.49 
 
 		 221 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  37.84 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  37.84 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  37.39 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  37.39 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  37.39 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  37.39 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  37.39 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  37.39 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  37.39 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 549 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  41.59 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  46.35 
 
 		 228 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  38.53 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  38.07 
 
 		 455 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  37.73 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  33 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  36.53 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 753 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  36.02 
 
 		 787 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  38.19 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 718 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  33.9 
 
 		 735 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  33.93 
 
 		 792 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 716 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  36.65 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  32.77 
 
 		 735 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 719 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 716 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 707 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 787 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 881 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 787 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 773 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  38.65 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 801 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  32.41 
 
 		 599 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>