168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1207 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1207  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
245 aa  503  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1155  alpha/beta hydrolase fold  49.79 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.230861  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0810  alpha/beta hydrolase fold  50.64 
 
 
264 aa  238  8e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0122335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1214  hypothetical protein  48.95 
 
 
239 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0887  hypothetical protein  48.95 
 
 
239 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0817  hypothetical protein  48.95 
 
 
239 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.467529  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1048  alpha/beta hydrolase fold protein  48.26 
 
 
239 aa  214  9e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  44.31 
 
 
247 aa  212  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  49.16 
 
 
353 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
240 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  23.7 
 
 
301 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  22.71 
 
 
298 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  18.52 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  27.71 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
299 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
303 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  21.77 
 
 
453 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  29.82 
 
 
284 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  25.51 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  24.59 
 
 
462 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.8 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  27.05 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  30.1 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  38.46 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  22.9 
 
 
437 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
296 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  20.65 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  29.46 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  35.35 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
298 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  26.75 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  25.94 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
282 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  26.75 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22 
 
 
268 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  18.65 
 
 
284 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  25.42 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 
301 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.67 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  21.35 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
504 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  34.57 
 
 
255 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  21.35 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 
462 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03006  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13070)  27.62 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  22.55 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  23.01 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  25 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  26.34 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.57 
 
 
374 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  26.67 
 
 
240 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  21.83 
 
 
339 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.97 
 
 
368 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  24.58 
 
 
255 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1903  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000527486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.74 
 
 
389 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 
309 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  23.08 
 
 
341 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3779  alpha/beta fold family hydrolase  31.63 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.385884  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3492  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000132504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3504  alpha/beta fold family hydrolase  31.63 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
323 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  24.7 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.87 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2444  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  34.88 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0199613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3759  hydrolase, alpha/beta fold family  24.56 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000154361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.97 
 
 
368 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>