More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0863 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  62.21 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  60.19 
 
 		 311 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  59.55 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  60.19 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  56.82 
 
 		 307 aa  348  7e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  56.82 
 
 		 307 aa  348  7e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  56.49 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  54.22 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  58.03 
 
 		 303 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  51.82 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  52.3 
 
 		 311 aa  295  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  52.84 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 313 aa  288  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  52.51 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  51.84 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  52.17 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  48.5 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  50.81 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  51.51 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  49.01 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  49.83 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  50.5 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  48.68 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 320 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 320 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  49.01 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  50 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  50.84 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  48.51 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  50.84 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  48.71 
 
 		 315 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  48.5 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  47.57 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  48.83 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  50.99 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  49.16 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  45.9 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  50.66 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  47.04 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  49.5 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  47.85 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  46.23 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  47.16 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  47.68 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  49.67 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  45.87 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 313 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  48.38 
 
 		 311 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  48.21 
 
 		 316 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  47.19 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  48.84 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  46.38 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 313 aa  262  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  47.22 
 
 		 339 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  46.86 
 
 		 313 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  45.57 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  47.7 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  45.87 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  48.05 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  47.56 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  45.07 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 		 313 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  45.37 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  45.87 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>