More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4511 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  100 
 
 		 358 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  77.96 
 
 		 312 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3629  transcription attenuator LytR  38.44 
 
 		 378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6385  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.56 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4011  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.12 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6384  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.52 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  38.23 
 
 		 420 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.59 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6317  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.18 
 
 		 390 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1681  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.64 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0240426  normal  0.562376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.27 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0942  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.26 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.28 
 
 		 625 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.96 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.44 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.44 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.44 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.99 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.88 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.46 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.41 
 
 		 573 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.74 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.19 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.56 
 
 		 320 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.57 
 
 		 486 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.91 
 
 		 434 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.58 
 
 		 466 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.48 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.43 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.62 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.14 
 
 		 468 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.45 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.8 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.73 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.61 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.08 
 
 		 491 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.54 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.16 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.79 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.96 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.46 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  33.77 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  27.05 
 
 		 530 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.16 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.39 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.32 
 
 		 521 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.47 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  36.02 
 
 		 296 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.18 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.58 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.78 
 
 		 504 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.92 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.3 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.65 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 489 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.27 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.47 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.98 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.64 
 
 		 618 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.98 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.46 
 
 		 567 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.09 
 
 		 522 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.73 
 
 		 732 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.85 
 
 		 560 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.73 
 
 		 516 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  35 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.32 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.98 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.98 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.55 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.2 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.67 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.95 
 
 		 1336 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.42 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.68 
 
 		 520 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.25 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  32.05 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  32.05 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  31.62 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.62 
 
 		 585 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.82 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  31.62 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  30.67 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.99 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  32.05 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.16 
 
 		 445 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 643 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.74 
 
 		 382 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.79 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.12 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.7 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  29.69 
 
 		 505 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.44 
 
 		 563 aa  98.2  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 296 aa  98.6  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>