228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4242 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  76.67 
 
 		 458 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 444 aa  882    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  51.43 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.97 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  52.1 
 
 		 180 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  53.17 
 
 		 212 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  50 
 
 		 495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  53.6 
 
 		 209 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  47.72 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  50.85 
 
 		 249 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  48.76 
 
 		 222 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52 
 
 		 213 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  46.71 
 
 		 211 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  52.54 
 
 		 541 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  46.79 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  48.85 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  48 
 
 		 167 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  46.15 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  45.1 
 
 		 242 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.03 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  45.59 
 
 		 203 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  47.24 
 
 		 283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  42.16 
 
 		 334 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  43.75 
 
 		 260 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  52.54 
 
 		 285 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  48.72 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  48.31 
 
 		 276 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  49.14 
 
 		 264 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  49.15 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  37.63 
 
 		 205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  49.15 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  49.15 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  49.15 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  49.15 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  49.15 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  47.93 
 
 		 226 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  49.15 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  40.49 
 
 		 274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  49.15 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  43.84 
 
 		 254 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  48.31 
 
 		 270 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  46.4 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  43.94 
 
 		 317 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  48.41 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  44.8 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  40.99 
 
 		 206 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  45.51 
 
 		 232 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  43.55 
 
 		 244 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  36.81 
 
 		 220 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  47.71 
 
 		 179 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.45 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  44.54 
 
 		 500 aa  99.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  36.84 
 
 		 157 aa  97.8  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  41.6 
 
 		 168 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  41.53 
 
 		 255 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  39.86 
 
 		 270 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  38.46 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  39.42 
 
 		 197 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  41.82 
 
 		 162 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  36.51 
 
 		 280 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  42.99 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  34.59 
 
 		 196 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  36.36 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  41.94 
 
 		 156 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.94 
 
 		 156 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  40.62 
 
 		 320 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  39.1 
 
 		 200 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  37.04 
 
 		 293 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  37.78 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  35.97 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  42.99 
 
 		 288 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.5 
 
 		 178 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  43.44 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  31.29 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  31.29 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2400  SCP-like extracellular  40.68 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00828302  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.27 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  39.42 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  36.97 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  35.29 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  37.3 
 
 		 275 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  31.55 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  40.19 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  36.44 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  40.6 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 		 551 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.5 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  28.83 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  35.25 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  38.26 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  33.79 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  39.02 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  38.52 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  35.21 
 
 		 258 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  33.58 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  35.88 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  38.21 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  33.58 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.78 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  40.3 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>