More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3688 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  100 
 
 		 311 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  89.71 
 
 		 311 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  56.82 
 
 		 330 aa  308  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.25 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.14 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  54.9 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  54.33 
 
 		 457 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  50.77 
 
 		 361 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  53.31 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.03 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  55.1 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.74 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  55.82 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  52.45 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  51.86 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  54.21 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  53.85 
 
 		 355 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  51.75 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  52.78 
 
 		 322 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.32 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  53.4 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  52.01 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  52.56 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  52.1 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  50.83 
 
 		 305 aa  278  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  52.23 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  51.37 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.23 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  53.15 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  49.3 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.55 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  51.19 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  50.7 
 
 		 314 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  50.68 
 
 		 318 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  51.92 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  50.52 
 
 		 348 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  53.82 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  49.66 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  53.61 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  45.8 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  50 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.51 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  52.38 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  52.45 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  49.48 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  50.86 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  50.86 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  50.86 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  46.85 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  60.09 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  53.36 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  46.05 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  51.36 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  49.15 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  52.03 
 
 		 306 aa  255  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  49.82 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  49.14 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  58.99 
 
 		 245 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  48.45 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  44.97 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  57.14 
 
 		 258 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  46.39 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  49.49 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  50.67 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  48.97 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.97 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  47.42 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  46.23 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.93 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  47.78 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  43.79 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  50 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.61 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  49.13 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  57.21 
 
 		 242 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  55.25 
 
 		 234 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  50.68 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  57.94 
 
 		 237 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.85 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 244 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  49.49 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  54.59 
 
 		 237 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  43.73 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  42.3 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.22 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  40.2 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>