224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2183 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2183  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
148 aa  295  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534725  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.72 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.7 
 
 
158 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.05 
 
 
152 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  49.33 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.92 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.18 
 
 
159 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  41.33 
 
 
151 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.96 
 
 
157 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
152 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 
157 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 
158 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  47.59 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.31 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  38.84 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  38.19 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.44 
 
 
145 aa  84.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  37.16 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.55 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.97 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  38.97 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  34.56 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.9 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  36.03 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.24 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.77 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.29 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  36.55 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.5 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.56 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.56 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  30.46 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.51 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.82 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.56 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  36.3 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  31.47 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  32.12 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.35 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  31.85 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  32.59 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.59 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  31.85 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.5 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  33.82 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.43 
 
 
157 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2452  hypothetical protein  35 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.18 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.46 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  42.42 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  30.92 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  31.85 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.07 
 
 
163 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.11 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.97 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.89 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.86 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.07 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.11 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  28.38 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.87 
 
 
283 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  26.52 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  34.31 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  30.37 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.09 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.35 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  35.04 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  30.37 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.26 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  39.45 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.11 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.31 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  29.05 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  34.31 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.11 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.11 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.11 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.11 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  31.11 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.11 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  30.15 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.61 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.07 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.63 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>