More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1275 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 317 aa  609  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  89.27 
 
 		 317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  67.19 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  58.36 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  57.65 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  58.14 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  55.49 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  61.29 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  56.07 
 
 		 344 aa  315  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  56.83 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  60.27 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  58.2 
 
 		 322 aa  298  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  57.28 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  51.68 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  62.38 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  59.32 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  51.92 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  50.81 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  50.15 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  48.81 
 
 		 341 aa  241  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  51.13 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  48.38 
 
 		 333 aa  231  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  43.71 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  51.3 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  51.3 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  51.09 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  51.3 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  42.47 
 
 		 370 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  48.42 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  44.71 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  43.69 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  38.65 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  38.63 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  44.14 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  41.85 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.92 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  45.65 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.27 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.6 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  36.71 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  36.86 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.98 
 
 		 350 aa  152  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  32.58 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.89 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  31.05 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.81 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  35.61 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  34.48 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  31.14 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  33.62 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  30.53 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  37.87 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  29.1 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  36.52 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  32.28 
 
 		 352 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  27.3 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  34.85 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  31.64 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  29.91 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  37.32 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  36.7 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  35.27 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  35.38 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  40.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  40.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  40.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  40.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  40.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  40.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  40.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  36.05 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  31.47 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  32.1 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  39.43 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.43 
 
 		 323 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.49 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  27.33 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  36.69 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.61 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.57 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  30.9 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  36.75 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  31.33 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  39.38 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  30.19 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  36.45 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.46 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.53 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  34.45 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>