More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3260 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  63.64 
 
 
251 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 
252 aa  208  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  35.19 
 
 
247 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
250 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
250 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
250 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 
229 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
249 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  35.96 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  33.74 
 
 
258 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
250 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
248 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  33.61 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.43 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
252 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0851  fructose operon transcriptional regulator  34.21 
 
 
232 aa  124  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.02 
 
 
253 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  34.21 
 
 
247 aa  121  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 
251 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
256 aa  121  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  32.5 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
253 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  30.08 
 
 
253 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  32.89 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 
254 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
260 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  28.09 
 
 
247 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  28.57 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 
250 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
253 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  30.61 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
274 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
267 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  31.6 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  31.02 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  30.38 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  26.72 
 
 
262 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  28.75 
 
 
257 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  26.67 
 
 
252 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
254 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
251 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  28.69 
 
 
256 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
251 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
263 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  29.84 
 
 
263 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  30.67 
 
 
255 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
251 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  29.05 
 
 
254 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
251 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
252 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
252 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  26.67 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  28.97 
 
 
278 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  26.67 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
251 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
254 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  27.64 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  27.64 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
252 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
252 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 
257 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 
248 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  26.67 
 
 
252 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl179  fru repressor  31.6 
 
 
230 aa  103  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  28.51 
 
 
256 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
251 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
253 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>