More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1135 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
142 aa  278  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  85.4 
 
 
141 aa  239  9e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
156 aa  86.7  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
137 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  32.14 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  28.57 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  31.69 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  28.47 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  34.27 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  28.68 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  27.94 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  22.06 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
240 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  25.74 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  25.34 
 
 
171 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  25.74 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 
165 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  24.26 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  31.53 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  26.43 
 
 
161 aa  62.8  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 
152 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  27.48 
 
 
308 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  25.71 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  33.65 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  23.91 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  23.91 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>