81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0968 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 
253 aa  483  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  46.8 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.74 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.15 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.7 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.59 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.94 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.71 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.98 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.58 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.94 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  26.42 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  26.42 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  26.42 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  26.42 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.53 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  26.53 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  26.53 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.18 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.92 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  26.42 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.33 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.31 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.72 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.58 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  26.5 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.66 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.71 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.55 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.67 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  26.02 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  27.09 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  26.69 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  26.69 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.8 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.55 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  26.29 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.44 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  26.64 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.04 
 
 
233 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.06 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  21.34 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.44 
 
 
267 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.05 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.88 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.64 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  54.84 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  30 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.36 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.59 
 
 
193 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  25.97 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.33 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.59 
 
 
193 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.32 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.3 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.82 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.95 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.34 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  23.77 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.43 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.67 
 
 
255 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.84 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.63 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.03 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.06 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.64 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  25.75 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  20.87 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  23.49 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.72 
 
 
264 aa  42  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 
254 aa  42  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>