245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3446 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  100 
 
 		 495 aa  988    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  81.71 
 
 		 499 aa  818    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  71.81 
 
 		 486 aa  710    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  86.26 
 
 		 498 aa  853    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  72.06 
 
 		 488 aa  709    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  75.92 
 
 		 503 aa  751    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  72.41 
 
 		 527 aa  719    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  77.8 
 
 		 488 aa  765    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  54.16 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  54.26 
 
 		 498 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  50 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  44.25 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  46.34 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  44.33 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  47.33 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  44.42 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  44.21 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  44.21 
 
 		 508 aa  435  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  44.44 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  44.12 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  44.33 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  44.12 
 
 		 508 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  44.33 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  44.54 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  44.33 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  45.23 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  45.77 
 
 		 503 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  45.57 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  45.36 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  44.74 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  43.24 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  42.02 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  42.74 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  43.01 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  41.87 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  41.41 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  43.19 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  38.71 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  39.01 
 
 		 524 aa  350  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  38.79 
 
 		 520 aa  349  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  38.66 
 
 		 525 aa  346  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  37.45 
 
 		 499 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  36.57 
 
 		 553 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  36 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.9 
 
 		 449 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  34.2 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.75 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  34.77 
 
 		 431 aa  209  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  31.93 
 
 		 518 aa  200  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.11 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  30.83 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.31 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.67 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  31.62 
 
 		 447 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  32.54 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  31.75 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  31.53 
 
 		 464 aa  194  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.3 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  31.41 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  33.11 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  31.75 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.15 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  29.86 
 
 		 436 aa  187  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.2 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  30.67 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.01 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  32.42 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  30.67 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  30.67 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.26 
 
 		 475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  30.72 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  30.82 
 
 		 446 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  31.89 
 
 		 446 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.3 
 
 		 453 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  31.89 
 
 		 446 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.39 
 
 		 486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  32.76 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  30.64 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  30.45 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  30.45 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  29.27 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  29.2 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.05 
 
 		 447 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  30.45 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.22 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1166 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.05 
 
 		 447 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  28.81 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  29.96 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  27.78 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  31.9 
 
 		 441 aa  180  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.11 
 
 		 443 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  31.41 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  32.42 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  30.8 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.14 
 
 		 464 aa  178  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  31.8 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  30.02 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>