More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2543 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 356 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  75.72 
 
 		 348 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  70 
 
 		 360 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  70.21 
 
 		 351 aa  494  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  70.15 
 
 		 349 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  66.48 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  67.33 
 
 		 386 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  67.23 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  70.18 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  67.23 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  65.38 
 
 		 399 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  67.51 
 
 		 401 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  67.44 
 
 		 373 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  68.7 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  67.92 
 
 		 391 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  58.15 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  48.15 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  47.48 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  47.77 
 
 		 346 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  47.18 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  46.55 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  44.09 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  45.51 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  45.64 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  44.6 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  43.8 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  45.35 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  43.93 
 
 		 362 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  45.35 
 
 		 356 aa  295  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  44.32 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  44.32 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  44.77 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  44.77 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  44.48 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  43.48 
 
 		 356 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  43.6 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  43.31 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  43.31 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  43.31 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  47.15 
 
 		 360 aa  282  8.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  43.02 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  43.9 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  42.49 
 
 		 371 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  38.68 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  39.88 
 
 		 364 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  40.31 
 
 		 373 aa  195  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.94 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.92 
 
 		 351 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  33.92 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.15 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  32.16 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  29.69 
 
 		 371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.94 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  29.49 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  30.28 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  29.57 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  29.57 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.44 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.36 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.29 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  39.51 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  33.77 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  31.18 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  34.08 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  30.65 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.43 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  29.22 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 		 362 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  33.22 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>