76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1966 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  65.84 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  55.9 
 
 		 334 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  48.74 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  55.25 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  54.94 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  54.63 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  56.56 
 
 		 365 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  48.59 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  55.94 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  55.94 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  55.94 
 
 		 365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  55.94 
 
 		 365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  56.27 
 
 		 354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  45.97 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  55.37 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  49.83 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  37.77 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35.39 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.77 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  33.23 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  37.38 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  35.06 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  34.39 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  33.65 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  31.72 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  28.86 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  30.82 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  30.62 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  27.43 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  32.23 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  29.87 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  26.8 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  28.76 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  28.21 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  31.09 
 
 		 374 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  27.67 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  29.77 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  29.77 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  26.16 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  28.79 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  25.88 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.37 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  24.05 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  25.79 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  23.95 
 
 		 344 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  26.58 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  27.36 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  26.83 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  27.88 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  24.22 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.36 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  27.87 
 
 		 346 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.86 
 
 		 341 aa  89  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  26.17 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  27.12 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  24.03 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  27.19 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  22.03 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  25.58 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  24.15 
 
 		 943 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  24.44 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  24.55 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  21.38 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  28 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  21.85 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  23.21 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  20.8 
 
 		 552 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  21.24 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  20 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  24.65 
 
 		 497 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>