128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0212 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  54.59 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  55.19 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  57.69 
 
 		 138 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  44.6 
 
 		 116 aa  99  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  31.74 
 
 		 872 aa  85.1  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  50.65 
 
 		 86 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  55.41 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  57.33 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  54.05 
 
 		 100 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  54.05 
 
 		 100 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 640 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  56 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  52.7 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  56 
 
 		 86 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  52.7 
 
 		 86 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  54.05 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 502 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 		 810 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 		 835 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  30.34 
 
 		 650 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 822 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  30.47 
 
 		 814 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  30.39 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 		 809 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  35.05 
 
 		 814 aa  62  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  41.56 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 627 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 826 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  33.1 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 846 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 780 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  32.11 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 599 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  32.11 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  32.38 
 
 		 472 aa  55.1  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 781 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 781 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  40.32 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  28.36 
 
 		 815 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 502 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  36.27 
 
 		 504 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  31.4 
 
 		 513 aa  52  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  32.48 
 
 		 500 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 		 509 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.58 
 
 		 513 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 502 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 513 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 514 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  26.11 
 
 		 841 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 513 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0268  hypothetical protein  41.54 
 
 		 105 aa  48.5  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 		 581 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  27.61 
 
 		 815 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  27.61 
 
 		 815 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  32.56 
 
 		 767 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  29.63 
 
 		 801 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  48.72 
 
 		 746 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  58.62 
 
 		 721 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  25.44 
 
 		 807 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 526 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  34.48 
 
 		 835 aa  46.2  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.37 
 
 		 772 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  28.24 
 
 		 842 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 736 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  34.88 
 
 		 805 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0129  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  40.82 
 
 		 540 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 		 782 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  28.24 
 
 		 842 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  25.44 
 
 		 842 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  25.44 
 
 		 842 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  28.24 
 
 		 842 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  36.76 
 
 		 871 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 		 730 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  28.83 
 
 		 778 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  31.78 
 
 		 773 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  36.51 
 
 		 87 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 		 607 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 785 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 		 568 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  25.15 
 
 		 841 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  35.71 
 
 		 736 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 		 724 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  36.05 
 
 		 824 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2964  copper-translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 753 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  48.65 
 
 		 737 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  22.87 
 
 		 846 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 485 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 735 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  64 
 
 		 744 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  55.88 
 
 		 797 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  56.76 
 
 		 446 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  32.35 
 
 		 761 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 451 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  56.67 
 
 		 816 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 801 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 798 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 826 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 795 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>