117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6726 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6726  putative endonuclease protein  100 
 
 		 285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1719  hypothetical protein  63.41 
 
 		 293 aa  331  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2423  xylose isomerase domain-containing protein  60.63 
 
 		 285 aa  318  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0964314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4007  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  59.93 
 
 		 269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2177  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.86 
 
 		 279 aa  295  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000702324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  61.15 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.834913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3367  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.84 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0137  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.35 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1079  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  56.36 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29070  sugar phosphate isomerase/epimerase  55.28 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06440  sugar phosphate isomerase/epimerase  54.92 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4011  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.75 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.45 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0606369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.39 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2281  hitchhiker  0.0000101278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2459  xylose isomerase domain-containing protein  47.31 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0140499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2853  xylose isomerase domain-containing protein  48.36 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3593  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.91 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.215314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3334  xylose isomerase domain-containing protein  46.95 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4583  xylose isomerase domain-containing protein  41.13 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1107  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0615  xylose isomerase domain-containing protein  43.9 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1856  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.36 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2882  xylose isomerase domain-containing protein  41.79 
 
 		 276 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.52 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  0.603305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4680  AP endonuclease  42.46 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110375  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04075  conserved hypothetical protein  42.06 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04037  hypothetical protein  42.06 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4453  AP endonuclease  41.67 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3803  xylose isomerase domain-containing protein  41.67 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465718  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4771  AP endonuclease  41.67 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.37 
 
 		 394 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  37.18 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362033  normal  0.0199285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.14 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.72 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2394  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.88 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4228  xylose isomerase domain-containing protein  32.59 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1876  xylose isomerase domain-containing protein  30.86 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3671  putative D-tagatose 3-epimerase  29.12 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  28.46 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3406  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1896  xylose isomerase-like TIM barrel  30.04 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1942  xylose isomerase domain-containing protein  30.04 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4709  myo-inositol catabolism protein  31.69 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0492702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4652  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  33.06 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4496  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  33.33 
 
 		 638 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0820  xylose isomerase domain-containing protein  31.16 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  20.22 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.59 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.36 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.9 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0189  xylose isomerase domain-containing protein  30.82 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3141  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2978  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.856422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29590  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.53 
 
 		 739 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2059  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, putative  35.71 
 
 		 687 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2495  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2225  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.25 
 
 		 635 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3760  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.41 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3702  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.74 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  27.89 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1528  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.11 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.25 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0577  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  37.04 
 
 		 687 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  29.94 
 
 		 635 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0848  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  37.04 
 
 		 684 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1894  putative amino acid dioxygenase  37.04 
 
 		 684 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4666  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.11 
 
 		 630 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.735725 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1752  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  37.04 
 
 		 684 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10433  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2205  putative 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  37.04 
 
 		 684 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0481  AP endonuclease  37.04 
 
 		 684 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0891  AP endonuclease  37.04 
 
 		 684 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.940921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3362  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.41 
 
 		 635 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.789434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0343  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  33.33 
 
 		 630 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  31.65 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  31.65 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3563  xylose isomerase domain-containing protein  24.89 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  31.65 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4538  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.12 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.535239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4905  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.54 
 
 		 633 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  25.14 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.77 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3418  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.89 
 
 		 630 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0242311  normal  0.14685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5194  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  29.57 
 
 		 630 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2554  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.77 
 
 		 635 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00914053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3062  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  34.56 
 
 		 630 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  34.56 
 
 		 630 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3161  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.77 
 
 		 635 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4963  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  34.56 
 
 		 630 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.89 
 
 		 624 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1560  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.52 
 
 		 632 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.288895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6806  xylose isomerase domain-containing protein  27.71 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  29.8 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  31.4 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0459  hydroxypyruvate isomerase  27.47 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4090  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.08 
 
 		 645 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4079  xylose isomerase domain-containing protein  32.61 
 
 		 629 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2130  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  31.61 
 
 		 635 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0402618  normal  0.678263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1099  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4578  xylose isomerase domain-containing protein  32.74 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.615471  normal  0.641383 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>