More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4856 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  100 
 
 		 446 aa  897    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  71.72 
 
 		 476 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  66.44 
 
 		 455 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  65.54 
 
 		 449 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  66.89 
 
 		 450 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  65.16 
 
 		 447 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  65.38 
 
 		 447 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  60.72 
 
 		 503 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  60.74 
 
 		 449 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  60.36 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  61.94 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  58.22 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  65.01 
 
 		 569 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  55.35 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  58.68 
 
 		 473 aa  450  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  54.09 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  54.57 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  52.6 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  45.43 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  43.58 
 
 		 473 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  45.15 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  46.65 
 
 		 481 aa  323  5e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  35.84 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  35.62 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  38.23 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  35.62 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  36.36 
 
 		 453 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  36.36 
 
 		 453 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  36.36 
 
 		 453 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  35.62 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  36.36 
 
 		 453 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  35.4 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  35.62 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  35.62 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  38.12 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.02 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  37.73 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  35.96 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  35.25 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  37.05 
 
 		 458 aa  263  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.94 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.25 
 
 		 494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  38.81 
 
 		 570 aa  223  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  35.1 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  39.03 
 
 		 579 aa  203  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  33.1 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  31.51 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  34.67 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.02 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  33.59 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  31.5 
 
 		 468 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  28.61 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.46 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  29.98 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.2 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  32.59 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  30.3 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.85 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  32.14 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.44 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  32.39 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  29.14 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  30.77 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  29.21 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  31.53 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  31.69 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.13 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  29.91 
 
 		 428 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  30.02 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  29.91 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  28.67 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  31.98 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  31.98 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  28.67 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.54 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.86 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  30.63 
 
 		 440 aa  170  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  29.64 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  31.56 
 
 		 445 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  32.48 
 
 		 456 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  32.48 
 
 		 456 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.79 
 
 		 429 aa  169  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  28.77 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.64 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  31.32 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.17 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  30.8 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  29.98 
 
 		 444 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.8 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  30.3 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.73 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  29.21 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  30.57 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  28.84 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  27.96 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  29.93 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  31.21 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.39 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2544  amidohydrolase  31.77 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.11 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>