More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4023 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4023  GrpE protein  100 
 
 		 176 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4434  GrpE protein  52.6 
 
 		 174 aa  174  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  62.59 
 
 		 177 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2172  GrpE protein  58.23 
 
 		 224 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.316744  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6428  GrpE protein  49.71 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  48.12 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1570  GrpE protein  44.59 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145005  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  43.66 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  41.61 
 
 		 260 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  36.99 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  48.09 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  40.41 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  41.79 
 
 		 198 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  36.09 
 
 		 221 aa  92  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  37.76 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  32.09 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.83 
 
 		 202 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  36.05 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  36.42 
 
 		 218 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  34.34 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.29 
 
 		 202 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.62 
 
 		 222 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 205 aa  87.8  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.15 
 
 		 210 aa  87.8  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  31.58 
 
 		 213 aa  87.8  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  35.71 
 
 		 250 aa  87.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  37.95 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  32.85 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.93 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.25 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.15 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 230 aa  85.1  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.04 
 
 		 243 aa  84.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 230 aa  85.1  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.42 
 
 		 208 aa  84.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 206 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 206 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  33.79 
 
 		 218 aa  84.3  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 206 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 206 aa  84.3  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  41.18 
 
 		 217 aa  84.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  29.94 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.48 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  35.86 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.96 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  37.06 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  32.87 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  29.05 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  35.16 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  32.17 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.24 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  35.29 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  36.42 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.61 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  37.11 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  36.67 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  33.11 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  35.87 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  34.81 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.87 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  32.21 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  39.46 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  36.09 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  35.21 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.94 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  30.83 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  36.46 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  31.72 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  32.21 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.8 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  34.04 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.43 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  31.74 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  31.47 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31.62 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  30.5 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>