289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3675 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  100 
 
 		 520 aa  998    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  33.05 
 
 		 499 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  34.36 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.65 
 
 		 496 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  37.92 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  30.85 
 
 		 497 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  30.79 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  31.3 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  33.11 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  31.3 
 
 		 495 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  31.18 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  28.24 
 
 		 497 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  30.82 
 
 		 483 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  31.44 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  29.59 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  27.31 
 
 		 497 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  27.56 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  29.15 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  27.56 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  27.72 
 
 		 490 aa  196  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  32.05 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.18 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  30 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  29.52 
 
 		 520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  29.35 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  26.74 
 
 		 507 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  26.46 
 
 		 506 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  29.1 
 
 		 517 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  25.67 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  29.7 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  28.01 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  27.16 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  28.05 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  28.05 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  27.44 
 
 		 462 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  26.52 
 
 		 501 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  25.54 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  28.8 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  26.52 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  26.52 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  26.52 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  29.69 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  26.33 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  28.24 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  28.89 
 
 		 510 aa  172  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  28.38 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  29.31 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  27.58 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  27.58 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  30.21 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  30.39 
 
 		 489 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  25.49 
 
 		 511 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  25.49 
 
 		 501 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 		 501 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  29.93 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 		 501 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  28.78 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  28.78 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  28.23 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  25.7 
 
 		 488 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  26.2 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  28.25 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  27.78 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  25.92 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  25.92 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  25.92 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  25.92 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  25.92 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  25.92 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  25.92 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  25.92 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  25.92 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  27.23 
 
 		 506 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  26.42 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  30.97 
 
 		 504 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  25.33 
 
 		 482 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  27.35 
 
 		 511 aa  160  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  27.29 
 
 		 500 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  27.29 
 
 		 461 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  26.2 
 
 		 516 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  25.67 
 
 		 461 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  25.47 
 
 		 461 aa  156  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  25.67 
 
 		 461 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  25.67 
 
 		 461 aa  156  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  25.67 
 
 		 461 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  25.67 
 
 		 461 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  26.64 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  25.88 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  25.47 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  25.47 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  26.85 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  25.69 
 
 		 461 aa  154  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  25.65 
 
 		 514 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  24.8 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  29.17 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  28 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  26.61 
 
 		 516 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>