53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3382 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3382  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.60132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5749  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.808729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23720  transcriptional regulator, tetR family  31.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232738 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  31.54 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  33.12 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2860  regulatory protein, TetR  24.34 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  26.24 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  30.77 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  31.91 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  30.23 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  32.26 
 
 		 196 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 209 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 183 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 195 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 298 aa  41.2  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>