More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2740 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  100 
 
 
287 aa  577  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  67.84 
 
 
288 aa  384  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  62.5 
 
 
303 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  52.04 
 
 
316 aa  292  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  51.55 
 
 
313 aa  281  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  46.64 
 
 
311 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  50.86 
 
 
315 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  49.31 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  48.63 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  47.64 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  47.49 
 
 
325 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  50.67 
 
 
319 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  49.31 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  49.83 
 
 
302 aa  242  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  41.2 
 
 
314 aa  238  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  41.1 
 
 
316 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  41.86 
 
 
310 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  49.32 
 
 
320 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  45.02 
 
 
295 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  46.83 
 
 
314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  29.89 
 
 
418 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  24.69 
 
 
337 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  27.81 
 
 
381 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  31.25 
 
 
297 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  32.04 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  30.58 
 
 
801 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  31.95 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  32.98 
 
 
816 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.06 
 
 
615 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  28.29 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  31.02 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  30.1 
 
 
302 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.27 
 
 
605 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  32.47 
 
 
308 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  27.59 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  26.88 
 
 
355 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  30.52 
 
 
300 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  26.47 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  32.25 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  30.19 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  25.68 
 
 
807 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  30.84 
 
 
300 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.58 
 
 
610 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  29.86 
 
 
841 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  29.29 
 
 
629 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.53 
 
 
804 aa  86.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.29 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.1 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  30.19 
 
 
804 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  31.92 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  30.42 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  28.33 
 
 
801 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  30.03 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  28.16 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.51 
 
 
604 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.99 
 
 
605 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.81 
 
 
839 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.9 
 
 
610 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  32.29 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  26.8 
 
 
800 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  30.74 
 
 
818 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  29.55 
 
 
804 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.01 
 
 
617 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  26.78 
 
 
841 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  29.38 
 
 
1247 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  28.92 
 
 
804 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  27.91 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  28.85 
 
 
804 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.68 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  28.8 
 
 
1226 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  28.1 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  26.26 
 
 
774 aa  76.3  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  30.84 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  29.69 
 
 
1271 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  28.52 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.02 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  25.48 
 
 
780 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  29.47 
 
 
1248 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 
791 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  27.9 
 
 
1241 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  30.52 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  28.52 
 
 
806 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  29.75 
 
 
1250 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  28.29 
 
 
1208 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  29.75 
 
 
1250 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  25.95 
 
 
819 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  29.31 
 
 
803 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  28.39 
 
 
346 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  29.81 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  27.81 
 
 
1189 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  23.86 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  28.12 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  27.91 
 
 
802 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  26.42 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.77 
 
 
615 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  29.35 
 
 
1171 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  28.34 
 
 
1169 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  25.82 
 
 
1180 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>