43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3266 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  39.01 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  35.98 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  35.62 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  36.53 
 
 		 245 aa  95.5  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  34.72 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  34.72 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  38.12 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  34.06 
 
 		 746 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  37.24 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  30.11 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  34.38 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0741  hypothetical protein  29.9 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  32.05 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  27.34 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  34.92 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  26.45 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  30.06 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1022 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0672  hypothetical protein  31.25 
 
 		 253 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  28.68 
 
 		 587 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  32.43 
 
 		 514 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  43.37 
 
 		 1123 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  32.86 
 
 		 409 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.17 
 
 		 590 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  35 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  35.71 
 
 		 2002 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  32.98 
 
 		 571 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  26.03 
 
 		 333 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0436  hypothetical protein  29.93 
 
 		 316 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  24.38 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  31.71 
 
 		 343 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  34.44 
 
 		 591 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1688  hypothetical protein  28.79 
 
 		 130 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  35.92 
 
 		 670 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1152 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.67 
 
 		 1035 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3946  hypothetical protein  24.29 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  29.01 
 
 		 299 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  32.05 
 
 		 610 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 463 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 		 538 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>