44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2252 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  57.86 
 
 		 821 aa  853    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  47.6 
 
 		 817 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  51.5 
 
 		 837 aa  731    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  56.21 
 
 		 835 aa  806    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  54.5 
 
 		 818 aa  769    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  48.93 
 
 		 807 aa  687    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  53.33 
 
 		 838 aa  766    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  49.77 
 
 		 819 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  53.06 
 
 		 820 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 851 aa  1684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  49.36 
 
 		 676 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  40.35 
 
 		 878 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  31.54 
 
 		 1209 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  31.31 
 
 		 1209 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.85 
 
 		 1224 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.85 
 
 		 1224 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  31.08 
 
 		 1224 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  31.61 
 
 		 1237 aa  286  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  34.5 
 
 		 638 aa  267  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  30 
 
 		 811 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  33.97 
 
 		 840 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  32.86 
 
 		 829 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  30.55 
 
 		 836 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  33.89 
 
 		 829 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  32.98 
 
 		 836 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  33.75 
 
 		 829 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  32.99 
 
 		 834 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  33.87 
 
 		 837 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  33.14 
 
 		 651 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  31.1 
 
 		 826 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  33.58 
 
 		 826 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  31.61 
 
 		 851 aa  206  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  32.76 
 
 		 843 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  31.38 
 
 		 830 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  29.91 
 
 		 851 aa  197  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  32.94 
 
 		 476 aa  167  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  29.55 
 
 		 638 aa  124  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  31.58 
 
 		 366 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  32.47 
 
 		 498 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  27.72 
 
 		 845 aa  87.4  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  32.47 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  25.96 
 
 		 1746 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.31 
 
 		 2795 aa  48.5  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  25.42 
 
 		 1976 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>