More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1499 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  69.28 
 
 
481 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
474 aa  958    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  54.29 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  55.15 
 
 
462 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  53.62 
 
 
463 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  52.94 
 
 
463 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
466 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  45.82 
 
 
466 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.99 
 
 
471 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
480 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  42.24 
 
 
461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
464 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  39.03 
 
 
467 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
472 aa  296  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
462 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
469 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
465 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  37.02 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
486 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
469 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
469 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  36.22 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
471 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
493 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
486 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
486 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.24 
 
 
469 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
458 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
481 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
463 aa  246  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
461 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  34.33 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  34.83 
 
 
463 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
471 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  33.69 
 
 
463 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
467 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  32.7 
 
 
464 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  32.58 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  32.58 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  32.58 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  32.58 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  32.58 
 
 
464 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  33.26 
 
 
484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  32.58 
 
 
464 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  40.31 
 
 
483 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
462 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  32.72 
 
 
715 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  41.41 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  34.75 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
477 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  35.04 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  33.04 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  37.34 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
474 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
474 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  34.53 
 
 
454 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.62 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  33.55 
 
 
454 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
482 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  34.3 
 
 
454 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  38.38 
 
 
463 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  32.17 
 
 
452 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
458 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
452 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  39.47 
 
 
459 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  36.39 
 
 
475 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  32.1 
 
 
452 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  31.74 
 
 
452 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000273191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
449 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  31.74 
 
 
452 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000189435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  32.1 
 
 
452 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.47 
 
 
462 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
445 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  31.88 
 
 
452 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
450 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  37.27 
 
 
460 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1683  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
452 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
458 aa  226  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  33.91 
 
 
472 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  38.18 
 
 
471 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
460 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
477 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
450 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
462 aa  223  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
472 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
472 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>