59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0300 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  477  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  65.65 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  57.96 
 
 		 284 aa  278  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  48.16 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  48.57 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  48.39 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  48.79 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  50.65 
 
 		 251 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  47.81 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  47.81 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  40.42 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  37.61 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  37.38 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  33.97 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  31.78 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  31.78 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  31.02 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  27.07 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  26.51 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  28.99 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  28.4 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  28.4 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  28.4 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  28.15 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  41.79 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.44 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0179  protein of unknown function DUF81  25.65 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  27.83 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  24.69 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  27.76 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  23.72 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  26.14 
 
 		 343 aa  49.3  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  24.68 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  30.81 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  24.44 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  22.77 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  26.15 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  23.72 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  26.75 
 
 		 344 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  29.25 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.14 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  42.39 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  24 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  29.84 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  27.7 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  26.67 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  24.18 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  22.84 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  29.28 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  24.62 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.65 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  28.65 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.65 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  28.65 
 
 		 247 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>