More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3891 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  69.16 
 
 		 454 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  942    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  68.28 
 
 		 454 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  69.16 
 
 		 454 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  73.13 
 
 		 453 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  69.82 
 
 		 454 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  68.94 
 
 		 454 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  71.81 
 
 		 454 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  68.94 
 
 		 454 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  68.94 
 
 		 454 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  68.94 
 
 		 454 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  69.16 
 
 		 454 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  68.5 
 
 		 454 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  66.81 
 
 		 459 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  63.08 
 
 		 455 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  37.95 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 557 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 557 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 		 562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 		 568 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  42.46 
 
 		 559 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  35.79 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  40.91 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 615 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 557 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  40.4 
 
 		 563 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 		 551 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  38.36 
 
 		 457 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  37.97 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  33.41 
 
 		 451 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 563 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  35.55 
 
 		 591 aa  209  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 453 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  33.64 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  27.83 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.85 
 
 		 518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  26.97 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  28.75 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  26.27 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30.21 
 
 		 580 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  30.04 
 
 		 393 aa  94  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  26.06 
 
 		 448 aa  93.6  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.29 
 
 		 593 aa  90.9  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 570 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  25.49 
 
 		 590 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  25.49 
 
 		 590 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  25.43 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.16 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  26.97 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  24.94 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  25.6 
 
 		 584 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.42 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  26.67 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  24.82 
 
 		 609 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  26.33 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.98 
 
 		 569 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.89 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  26.92 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  26.92 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  23.38 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  24.03 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3826  AMP-dependent synthetase and ligase  24.09 
 
 		 700 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3351  AMP-dependent synthetase and ligase  25.28 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4680  coronafacic acid synthetase, ligase component  24.44 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.128923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  24.67 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  23.4 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  28.08 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  25.14 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  25.13 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  25.45 
 
 		 673 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  24.1 
 
 		 655 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  24.1 
 
 		 655 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  22.62 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  25.95 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  29.18 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  25.21 
 
 		 1070 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  23.77 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  23.78 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  21.96 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  25.35 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  24.93 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  23.84 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  25.67 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  25.67 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  25.06 
 
 		 1643 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2364  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 		 497 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472982  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  25.67 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  22.95 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  24.93 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  22.7 
 
 		 656 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  22.88 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  23.7 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  24.86 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  25.33 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>