More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1819 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  100 
 
 		 394 aa  791    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  38.02 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  33.42 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0103  4-coumarate--CoA ligase  29.71 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  32.04 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  30.7 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.28 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.81 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.75 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30.5 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 570 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  31.37 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  31.03 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  31.03 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  28.92 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  29.18 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  27.69 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  29.26 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  31.1 
 
 		 584 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  30.31 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.02 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  25.49 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  25.16 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  26.09 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  25.16 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 561 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  28.43 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.8 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  28.89 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  25.82 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  24.84 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  25.6 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  25.14 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  23.37 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  29.17 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  22.15 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  22.11 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3344  acyl-CoA synthetase  25.49 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  hitchhiker  0.0000000000000207537 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1797  acyl-CoA synthetase  25.16 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  25.64 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  29.14 
 
 		 609 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  24.53 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  24.41 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  24.27 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  27.22 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.1 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  25.66 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.12 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.22 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  22.97 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  29.45 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  24.41 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  24.68 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  24.68 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  24.68 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  24.35 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  28.83 
 
 		 609 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  24.68 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  24.85 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  35.45 
 
 		 1035 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.43 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  25 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  25 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.9 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3695  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.15 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  25 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  25 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4782  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  23.4 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.259777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  24.06 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0956  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  24.61 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.17 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.15 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.63 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3334  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000448213  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  25.15 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>