82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3330 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 137 aa  276  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.24 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3341  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.89 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00402112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0949  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.89 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.543665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1051  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.89 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1018  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.89 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.26 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.1 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3672  TonB system transport protein ExbD1  56.91 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0963  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.72 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1753  TonB system transport protein ExbD1  42.65 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  48.82 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  43.38 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001353  biopolymer transport protein ExbD1  41.91 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000434471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  27.87 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0812  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  26.87 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.63 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  27.78 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6364  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00896769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1714  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  27.87 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.95 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  25 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  23.13 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  27.87 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344819  normal  0.411773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  27.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  20.8 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5005  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  20.8 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.8 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.12 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  25.93 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  26.19 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  23.66 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.12 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.76 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  26.67 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 140 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 		 139 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.07 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.07 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  23.58 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7323  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.22 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  22.22 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.73 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  23.08 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.97 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  22.14 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.9 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  27.91 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0690  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  22.69 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.95 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.9 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.66 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  24.59 
 
 		 154 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.06 
 
 		 141 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 141 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>