186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3299 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  95.28 
 
 
347 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  87.26 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  86.79 
 
 
344 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  86.79 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  85.38 
 
 
349 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  86.79 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  83.96 
 
 
344 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  84.91 
 
 
344 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  85.38 
 
 
345 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  84.43 
 
 
341 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  83.96 
 
 
344 aa  390  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  84.43 
 
 
341 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  83.49 
 
 
341 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  83.49 
 
 
341 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  81.6 
 
 
347 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  76.89 
 
 
329 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  63.16 
 
 
370 aa  291  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  56.13 
 
 
341 aa  268  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  54.72 
 
 
336 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  56.81 
 
 
326 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  55.02 
 
 
336 aa  258  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  84.67 
 
 
139 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  56.81 
 
 
325 aa  252  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  55.98 
 
 
327 aa  252  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  55.98 
 
 
327 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  56.34 
 
 
325 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  55.87 
 
 
325 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  56.34 
 
 
325 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  54.29 
 
 
323 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  56.34 
 
 
325 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  55.4 
 
 
325 aa  248  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  55.77 
 
 
327 aa  247  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  55.4 
 
 
325 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  55.4 
 
 
325 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  54.25 
 
 
325 aa  245  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  54.93 
 
 
325 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  54.93 
 
 
325 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  54.46 
 
 
323 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.81 
 
 
327 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  54.33 
 
 
327 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  55.5 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  53.77 
 
 
325 aa  242  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  54.46 
 
 
325 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.55 
 
 
327 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  54.55 
 
 
327 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  50.68 
 
 
370 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  55.02 
 
 
326 aa  241  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  53.99 
 
 
325 aa  241  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  53.99 
 
 
326 aa  240  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  53.99 
 
 
325 aa  240  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  53.77 
 
 
325 aa  240  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  53.99 
 
 
325 aa  240  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  53.99 
 
 
325 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  51.42 
 
 
325 aa  239  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  53.49 
 
 
325 aa  239  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  53.99 
 
 
325 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  54.67 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  54.55 
 
 
325 aa  238  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  51.42 
 
 
325 aa  238  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  51.42 
 
 
325 aa  238  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  52.13 
 
 
325 aa  238  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  53.52 
 
 
325 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  52.83 
 
 
325 aa  238  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  53.99 
 
 
325 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  53.05 
 
 
326 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  52.58 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  54.07 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  53.59 
 
 
325 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  53.52 
 
 
326 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  53.99 
 
 
325 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  54.46 
 
 
325 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  53.52 
 
 
326 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  53.52 
 
 
325 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  53.05 
 
 
316 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  52.58 
 
 
325 aa  235  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  52.11 
 
 
325 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  51.64 
 
 
325 aa  235  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  53.05 
 
 
325 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  53.05 
 
 
325 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  53.05 
 
 
325 aa  234  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  52.58 
 
 
325 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.07 
 
 
208 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  51.64 
 
 
325 aa  232  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  52.11 
 
 
325 aa  231  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  51.64 
 
 
325 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  55 
 
 
319 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  47.42 
 
 
377 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  51.17 
 
 
325 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  51.2 
 
 
328 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  51.18 
 
 
324 aa  222  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  53.05 
 
 
326 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  50.23 
 
 
325 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  51.15 
 
 
329 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  49.3 
 
 
325 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  54.4 
 
 
198 aa  210  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  53.37 
 
 
293 aa  201  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  51.67 
 
 
198 aa  198  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  51.67 
 
 
198 aa  198  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  56.05 
 
 
271 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>