205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0136 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  100 
 
 
267 aa  553  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  62.26 
 
 
264 aa  360  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  61.8 
 
 
255 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  61.8 
 
 
255 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  61.42 
 
 
255 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  61.8 
 
 
255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  61.42 
 
 
255 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  61.8 
 
 
255 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  61.8 
 
 
255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  63.02 
 
 
255 aa  338  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  61.8 
 
 
255 aa  337  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  57.41 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  56.67 
 
 
267 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  52.63 
 
 
257 aa  284  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  51.49 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  50.55 
 
 
263 aa  278  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  44.65 
 
 
266 aa  249  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  42.96 
 
 
269 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  40.43 
 
 
268 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  39.07 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 
276 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  35.82 
 
 
280 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  33.81 
 
 
273 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  34.53 
 
 
273 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  33.81 
 
 
273 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  32.75 
 
 
279 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  38.01 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
283 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  37.33 
 
 
285 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  37.33 
 
 
285 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  32.97 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  31.67 
 
 
278 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  35.74 
 
 
283 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  36.3 
 
 
285 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  35.05 
 
 
283 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 
294 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  34.88 
 
 
283 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  33.69 
 
 
277 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  29.43 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  33.11 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  33 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  31.16 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
269 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  28.7 
 
 
268 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  43.31 
 
 
159 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  25.87 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  26.29 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  26.29 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  33.9 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  26.57 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  23.14 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  26.09 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  26.09 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  25.37 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.91 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  25.24 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  25.68 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  25.68 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  24.64 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  24.27 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.55 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  24.2 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.64 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.33 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  23.64 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.81 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  25.65 
 
 
362 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  24.67 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  23.64 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.43 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  24.4 
 
 
262 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  22.96 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  23.36 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  24.54 
 
 
251 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  24.54 
 
 
251 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.22 
 
 
236 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.38 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  28.45 
 
 
229 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  24.87 
 
 
274 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.16 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  26.86 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  25 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  34.26 
 
 
541 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  26.41 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.22 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  30.23 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 
541 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  25.55 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  36.36 
 
 
541 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 
541 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>