77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5841 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  870    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  38.86 
 
 		 432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  39.03 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  35.21 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  34.26 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 416 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 454 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  35.03 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 476 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  37.41 
 
 		 432 aa  183  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 491 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  35.24 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  35.29 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  35.29 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  35.29 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.79 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  23.94 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  20.48 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.89 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  25.29 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 543 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  22.8 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  28.43 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  27.21 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  27.21 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  27.21 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  27.21 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  26.67 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 543 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.14 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  32.08 
 
 		 707 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 482 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  35 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  34.41 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  31.53 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  27.04 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  30.63 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  26.52 
 
 		 561 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.72 
 
 		 686 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  30.63 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  30.63 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  30.63 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  26.42 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  17.84 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  26.55 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  30.63 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  30.63 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>