268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5742 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  83.93 
 
 		 115 aa  193  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  61.82 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  60 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  59.8 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  49.53 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  49.11 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  51.35 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  48.62 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  48.62 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  48.62 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  49.53 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  52.63 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  32.65 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  36.56 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  31 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.69 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  32.99 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.28 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  32.99 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0522  PadR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34.04 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  31.96 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  31.96 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  31.96 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  42.35 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  31.96 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  29 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  43.24 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  29 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  38.04 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  30.91 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  31.3 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  34.69 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  32.63 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 188 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  34.44 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  28.43 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>