More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4386 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  61.08 
 
 		 719 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  51.8 
 
 		 787 aa  648    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  55.19 
 
 		 694 aa  646    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  54.86 
 
 		 712 aa  690    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  53.36 
 
 		 700 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  55.74 
 
 		 674 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  55.09 
 
 		 702 aa  685    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  51.59 
 
 		 717 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  53.74 
 
 		 736 aa  638    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 697 aa  1400    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  52.88 
 
 		 701 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  56.12 
 
 		 682 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  51.98 
 
 		 726 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.4 
 
 		 689 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  53.84 
 
 		 708 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  53.64 
 
 		 710 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  60.78 
 
 		 719 aa  745    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.78 
 
 		 709 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  54.42 
 
 		 707 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  55.18 
 
 		 685 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  54.27 
 
 		 714 aa  628  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  54.27 
 
 		 707 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  53.58 
 
 		 707 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  52.3 
 
 		 717 aa  616  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  51.43 
 
 		 697 aa  607  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.57 
 
 		 704 aa  604  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.16 
 
 		 710 aa  593  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  52.48 
 
 		 684 aa  589  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0935  UvrD/REP helicase  52.07 
 
 		 759 aa  581  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00354406  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.56 
 
 		 699 aa  579  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  51.1 
 
 		 685 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 670 aa  555  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  48.77 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  45.81 
 
 		 690 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  62.59 
 
 		 876 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  45.83 
 
 		 643 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  47.92 
 
 		 508 aa  317  4e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  32.75 
 
 		 706 aa  253  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.68 
 
 		 739 aa  246  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  37.37 
 
 		 515 aa  243  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  33.96 
 
 		 746 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.86 
 
 		 718 aa  241  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  31.03 
 
 		 845 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 724 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.87 
 
 		 751 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  35.07 
 
 		 714 aa  227  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.73 
 
 		 711 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  33.66 
 
 		 795 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.24 
 
 		 686 aa  221  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  33.66 
 
 		 795 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  34.51 
 
 		 807 aa  220  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  32.31 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  34.57 
 
 		 1050 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  35.73 
 
 		 736 aa  217  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.21 
 
 		 773 aa  216  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  29.83 
 
 		 758 aa  216  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  35.89 
 
 		 737 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.81 
 
 		 741 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  29.11 
 
 		 724 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.14 
 
 		 713 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  37.23 
 
 		 715 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  33.41 
 
 		 770 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.49 
 
 		 932 aa  213  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.38 
 
 		 762 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.22 
 
 		 802 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.73 
 
 		 663 aa  211  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  35.75 
 
 		 705 aa  211  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 		 706 aa  211  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 1032 aa  210  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  32.85 
 
 		 797 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.01 
 
 		 715 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.96 
 
 		 763 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.61 
 
 		 759 aa  209  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 741 aa  209  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.85 
 
 		 763 aa  209  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.82 
 
 		 858 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  25.8 
 
 		 698 aa  207  4e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  34.13 
 
 		 731 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  34.53 
 
 		 732 aa  206  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.97 
 
 		 781 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.48 
 
 		 737 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.56 
 
 		 742 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.81 
 
 		 762 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.42 
 
 		 768 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 806 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.82 
 
 		 689 aa  205  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  32.79 
 
 		 744 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.75 
 
 		 797 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.39 
 
 		 732 aa  204  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.09 
 
 		 831 aa  204  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.94 
 
 		 730 aa  204  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.25 
 
 		 725 aa  203  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  35.87 
 
 		 812 aa  203  8e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.17 
 
 		 1089 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.89 
 
 		 838 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  35.99 
 
 		 726 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  35.82 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.66 
 
 		 851 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  31.8 
 
 		 625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  35.59 
 
 		 401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>