More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1702 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
438 aa  838    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1463  major facilitator superfamily MFS_1  69.25 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  32.04 
 
 
426 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
418 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  29.2 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.72 
 
 
436 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  32.29 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
433 aa  126  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
412 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.08 
 
 
413 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.46 
 
 
418 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  31.55 
 
 
429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.32 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.27 
 
 
429 aa  120  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  30.19 
 
 
405 aa  120  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  29 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.6 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.37 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.89 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  30.28 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  30.28 
 
 
425 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  28.64 
 
 
410 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.93 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
415 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  32.37 
 
 
474 aa  117  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
417 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  33.95 
 
 
450 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  32.2 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  31.31 
 
 
416 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.34 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
421 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  30.59 
 
 
441 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  32.95 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  32.95 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  30.63 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  32.95 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  32.5 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
413 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  31.28 
 
 
426 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
494 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  27.76 
 
 
428 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
417 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
423 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 
404 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
419 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
402 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
433 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  28.67 
 
 
413 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
432 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.05 
 
 
446 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  31.25 
 
 
412 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
435 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
446 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
404 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
431 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  30.08 
 
 
418 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  29.28 
 
 
435 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.3 
 
 
446 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  31.25 
 
 
457 aa  103  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
401 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  30.75 
 
 
413 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
441 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.25 
 
 
403 aa  101  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  30.85 
 
 
450 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
414 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.88 
 
 
426 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  31.5 
 
 
414 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
442 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
453 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
417 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  29.61 
 
 
452 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  29.48 
 
 
441 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  23.72 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
428 aa  97.8  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
436 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  36.36 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  28.46 
 
 
423 aa  96.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.93 
 
 
414 aa  96.3  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.01 
 
 
1833 aa  96.3  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  25.83 
 
 
524 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  32.08 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  28.43 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
456 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  28.87 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  31.58 
 
 
530 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.35 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>