More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0934 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  57.35 
 
 
218 aa  230  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  50.23 
 
 
226 aa  204  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  48.36 
 
 
219 aa  192  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  46.7 
 
 
217 aa  189  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  47.37 
 
 
221 aa  185  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  47.49 
 
 
227 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  47.2 
 
 
222 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  48.58 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  42.66 
 
 
227 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  45.79 
 
 
214 aa  177  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  44.98 
 
 
226 aa  177  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.23 
 
 
526 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  45.24 
 
 
215 aa  174  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.85 
 
 
510 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  42.53 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  39.45 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.87 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.37 
 
 
511 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  42.72 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.91 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  42.72 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.37 
 
 
511 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  43.26 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  42.59 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  45.79 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.78 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  44.91 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  40.09 
 
 
231 aa  171  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  39.91 
 
 
230 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  42.33 
 
 
225 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  42.99 
 
 
224 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  38.43 
 
 
233 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  40.28 
 
 
244 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  38.39 
 
 
235 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  41.89 
 
 
238 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  40.27 
 
 
232 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  38.36 
 
 
233 aa  168  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  43.66 
 
 
231 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  38.74 
 
 
240 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.54 
 
 
510 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  38.01 
 
 
233 aa  167  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  43.52 
 
 
225 aa  167  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  38.71 
 
 
223 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  38.53 
 
 
231 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  38.07 
 
 
233 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.19 
 
 
516 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  40.55 
 
 
237 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  44.75 
 
 
230 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.19 
 
 
516 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  40.74 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  42.86 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  38.16 
 
 
269 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.22 
 
 
529 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  42.59 
 
 
225 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  42.59 
 
 
225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  39.11 
 
 
228 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  42.79 
 
 
237 aa  164  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0349  cytidylate kinase  41.83 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.229636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  42.59 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  42.59 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  42.59 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  42.59 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  38.01 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  42.59 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  42.79 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  42.79 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  40.65 
 
 
237 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  43.19 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  42.2 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.2 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  42.2 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.2 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.2 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  39.91 
 
 
514 aa  161  6e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  38.28 
 
 
233 aa  161  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  37.89 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  40.95 
 
 
220 aa  160  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  41.9 
 
 
227 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  37.91 
 
 
227 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.24 
 
 
509 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.25 
 
 
230 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.25 
 
 
230 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  42.93 
 
 
217 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.1 
 
 
528 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  38.07 
 
 
234 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  42.86 
 
 
226 aa  159  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  40 
 
 
229 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.2 
 
 
227 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  40.62 
 
 
230 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  40.09 
 
 
220 aa  158  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.93 
 
 
509 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  41.95 
 
 
217 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  158  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  39.72 
 
 
229 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  38.5 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  40 
 
 
236 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  41.28 
 
 
230 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  38.25 
 
 
251 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  41.28 
 
 
230 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>