More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5817 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  293  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  76.81 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  70.29 
 
 		 183 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.92 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  47.37 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  43.85 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  46.56 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.43 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  44.36 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  45.38 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  56 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  43.08 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  44.12 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  43.85 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 176 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  52.04 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  45.38 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  45.38 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  57 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  47.5 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  56 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 185 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  43.38 
 
 		 150 aa  103  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 267 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  43.85 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  43.08 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  44.27 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  47.2 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  42.4 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  43.75 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.58 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.58 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  50 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 191 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  43.55 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  41.94 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 196 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>