More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4583 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 396 aa  800    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  37.26 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.47 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  32.18 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  27.64 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  44.71 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 669 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 678 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  38.2 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  44.71 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  34.37 
 
 		 369 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  34.51 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 		 443 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  28.85 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  39.35 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  38.99 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  42.69 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.21 
 
 		 347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 890 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  37.33 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 353 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  27.89 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  27.27 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  27.58 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  28.25 
 
 		 347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.05 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  40 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 808 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  26.17 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  42.35 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.83 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.83 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.83 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.83 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.51 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  27.93 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 346 aa  123  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  32.19 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 660 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.31 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  42.35 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 762 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.35 
 
 		 352 aa  117  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  25.84 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  22.22 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  40.83 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.17 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.17 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 361 aa  106  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  40.4 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>