More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2994 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  51.89 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  50.81 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  54.1 
 
 		 194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  53.4 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  52.69 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 190 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  48.63 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  50.26 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  51.55 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  48.65 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  48.97 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  45.41 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.86 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  44.81 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  42.92 
 
 		 238 aa  161  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  44.26 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  48.35 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  48.44 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  41.26 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  45.13 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  44.21 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  40.54 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  42.33 
 
 		 240 aa  134  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  36.28 
 
 		 239 aa  131  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  44.57 
 
 		 195 aa  131  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  40.78 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  40.78 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  40.78 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  39.66 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 		 212 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  37.84 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  37.99 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  52.78 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  50.76 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  34.25 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  33.33 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.56 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.03 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.03 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.03 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  34.62 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 412 aa  75.1  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.65 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.15 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.15 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.15 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.15 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.15 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.15 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 212 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.51 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.15 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  25.93 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>