More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2981 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  65.43 
 
 		 245 aa  324  7e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  65.7 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  64.61 
 
 		 244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.66 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  61.69 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  61.04 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  64.2 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  61.73 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.14 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  62.14 
 
 		 259 aa  304  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  62.55 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  60.8 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  62.7 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.91 
 
 		 262 aa  299  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.04 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  62.66 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  62.81 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  62.3 
 
 		 243 aa  298  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  59.84 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  60.25 
 
 		 251 aa  297  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.61 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  59.76 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.34 
 
 		 246 aa  296  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.91 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  59.26 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  60.71 
 
 		 256 aa  295  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.66 
 
 		 264 aa  295  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  61.48 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  58.85 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  60.08 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  59.92 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  58.96 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  58.44 
 
 		 246 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 257 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 269 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  58.26 
 
 		 263 aa  294  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.09 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  60.91 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  57.77 
 
 		 263 aa  293  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  57.85 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.56 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  60.74 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.22 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.75 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.17 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  61.41 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  59.76 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  60.66 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 273 aa  292  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  59.5 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.56 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59.67 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.28 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  60.49 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 252 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  60.66 
 
 		 252 aa  291  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.67 
 
 		 252 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.75 
 
 		 246 aa  291  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  57.44 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.75 
 
 		 258 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.75 
 
 		 258 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  59.09 
 
 		 260 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  58.61 
 
 		 260 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.09 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.02 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  59.34 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  60.76 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  60.49 
 
 		 257 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  60.49 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.92 
 
 		 241 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.11 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.92 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  59.67 
 
 		 246 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.92 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  59.34 
 
 		 267 aa  289  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.34 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  56.15 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  61 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 252 aa  288  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 252 aa  288  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  60.91 
 
 		 248 aa  289  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 		 252 aa  288  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.79 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  60.25 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  58.02 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  58.02 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.26 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  57.44 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  58.02 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  58.02 
 
 		 252 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  58.51 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>