More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3502 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 432 aa  882    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  46.92 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  39.31 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  39.45 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  37.61 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  40.14 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  40.14 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  40.14 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  38.13 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  39.36 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  39.55 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  39.32 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  39.09 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  38.72 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  38.72 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  37.98 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  39.31 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  35.91 
 
 		 437 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 		 432 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  26.3 
 
 		 845 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.88 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  23.96 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.23 
 
 		 808 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  28.41 
 
 		 805 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.29 
 
 		 805 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.49 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 797 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  27.39 
 
 		 414 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  22.48 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 714 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.52 
 
 		 871 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  27.8 
 
 		 831 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 798 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  24.71 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  26.18 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  26.44 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  24.89 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.06 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.4 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.5 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 		 808 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.55 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.55 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  26.22 
 
 		 806 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  27.1 
 
 		 663 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  25.71 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 		 800 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.41 
 
 		 882 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  25.71 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.17 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.87 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  25.57 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  26.03 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  26.09 
 
 		 809 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  26.22 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  26.96 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  23.5 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 		 805 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.4 
 
 		 913 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 791 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  24.72 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 		 805 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  27.5 
 
 		 805 aa  76.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  24.03 
 
 		 814 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  27.1 
 
 		 803 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  28.48 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  22.38 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.47 
 
 		 817 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0375  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.87 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  23.41 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  25.39 
 
 		 798 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  20.41 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  22.42 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.77 
 
 		 822 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  23.7 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  24.1 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.71 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.32 
 
 		 844 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 804 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.84 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>