63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0796 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 152 aa  313  6e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  84.87 
 
 		 153 aa  274  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  34.92 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  34.15 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  34.33 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  34.33 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  34.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  33.58 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  31.51 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  30.94 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  30.77 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  32.61 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  32.61 
 
 		 404 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  29.5 
 
 		 365 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  29.03 
 
 		 383 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  28.48 
 
 		 433 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  28.68 
 
 		 284 aa  57  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  32.58 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  29.41 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  28.68 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  30.65 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  29.23 
 
 		 315 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  30.15 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  30.6 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 326 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  32.14 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 326 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  28.15 
 
 		 235 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  32 
 
 		 287 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  30.71 
 
 		 226 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  27.05 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  29.23 
 
 		 278 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  31.76 
 
 		 429 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  27.14 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  29.23 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  29.23 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  27.05 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  32.09 
 
 		 375 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  26.77 
 
 		 245 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  28.89 
 
 		 476 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  26.67 
 
 		 391 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  29.23 
 
 		 245 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  29.51 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  30.87 
 
 		 429 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  44.68 
 
 		 474 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  31.06 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  32.06 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  44.68 
 
 		 472 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  47.62 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  45.65 
 
 		 476 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  45.65 
 
 		 496 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  28.21 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  28.89 
 
 		 409 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  27.48 
 
 		 432 aa  44.3  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 		 488 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5334  hypothetical protein  30.83 
 
 		 300 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632965  normal  0.811239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  29.92 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  27.91 
 
 		 412 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  27.13 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  31.97 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5166  cell wall hydrolase SleB  30 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>