63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0552 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  100 
 
 		 287 aa  569  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  58.45 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  52.98 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  52.98 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  35.12 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  42.63 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  31.27 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  31.15 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  33.51 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  30 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  30.2 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  28.29 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  37.3 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  34.03 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  29.64 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3311  general secretion pathway protein K, putative  27.9 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  29.14 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3145  general secretion pathway protein K, putative  27.04 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.132735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  27.19 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  26.88 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  31.22 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  30.18 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2177  general secretion pathway protein GspK  27.4 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  27.57 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  28.77 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  25.36 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  28.04 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  25.47 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0682  general secretory pathway protein K  31.23 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.0114744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  30.73 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  25.12 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  31.37 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  36.71 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  33.33 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  32.48 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  24.76 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  26.91 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  26.29 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  24.58 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  25.59 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  26.42 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  26.03 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  25.59 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  25.59 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  25.59 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  29.11 
 
 		 586 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1607  hypothetical protein  27.12 
 
 		 404 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  25.94 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2099  hypothetical protein  26.89 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165009  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  25.47 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  35.9 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.11 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  34.04 
 
 		 362 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  34.29 
 
 		 354 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  26.27 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  32.94 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  30.19 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  25.71 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1786  putative general secretion pathway protein K  28.99 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  31.65 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>