38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6339 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 406 aa  836    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  50.26 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  35.22 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  32.11 
 
 		 379 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  30.87 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2753  FG-GAP repeat-containing protein  23.01 
 
 		 797 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  24.12 
 
 		 1337 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.76 
 
 		 1838 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2511  FG-GAP repeat-containing protein  22.62 
 
 		 785 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.377601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  24.1 
 
 		 1348 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  23.53 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  24.86 
 
 		 895 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  25.18 
 
 		 811 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.63 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25 
 
 		 1126 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4551  FG-GAP repeat protein  40.66 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  23.29 
 
 		 752 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  23.36 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.03 
 
 		 604 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  20.92 
 
 		 1019 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  26.85 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  23.06 
 
 		 1433 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  23.36 
 
 		 1437 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25 
 
 		 2807 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  19.75 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  21.32 
 
 		 1346 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  29.23 
 
 		 1127 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.79 
 
 		 1557 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.2 
 
 		 1490 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  21.99 
 
 		 616 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1009 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  19.87 
 
 		 1289 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6276  hypothetical protein  27.43 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1825 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1806 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1825 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.04 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  23.96 
 
 		 2031 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>