283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6250 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  47.13 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  43.93 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.53 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.34 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  41.38 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  35.26 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  39.08 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  41.86 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  40.94 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.31 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  38.51 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  38.15 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  37.57 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.99 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  36.99 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  37.57 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  36.99 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  36.99 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  36.99 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  36.99 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  42.11 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  36.05 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  38.29 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  38.74 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.06 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  37.43 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.47 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.29 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.01 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.87 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  36.87 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  36.31 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  39.18 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  35.98 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  38.92 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.79 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  37.29 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  37.71 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  35.43 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  32.56 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  37.21 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  35.2 
 
 		 390 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  35.59 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.57 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  34.95 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.9 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  32.34 
 
 		 198 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 		 180 aa  94.4  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.94 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  33.71 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  33.71 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 199 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  29.21 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  33.73 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  34.05 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 180 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  34.41 
 
 		 196 aa  87.8  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.67 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.57 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0724  dihydrofolate reductase family protein  36.17 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  30.43 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  34.05 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.5 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  29.05 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  34.76 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  31.89 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3404  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.34 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.011161  hitchhiker  0.00121534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.16 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.93 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.08 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  33.85 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>