More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5102 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
166 aa  347  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  76.22 
 
 
165 aa  275  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  54.76 
 
 
170 aa  193  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  59.09 
 
 
161 aa  192  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1378  NADH dehydrogenase I chain E  53.75 
 
 
177 aa  184  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.41658  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  55.77 
 
 
166 aa  178  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.53 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1242  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  48.7 
 
 
176 aa  160  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.96 
 
 
208 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  45.62 
 
 
181 aa  152  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  47.8 
 
 
249 aa  149  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  45.91 
 
 
239 aa  148  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  45.22 
 
 
180 aa  147  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  42.94 
 
 
168 aa  147  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  41.4 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2296  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.79 
 
 
222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  45.16 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  43.59 
 
 
262 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1306  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.68 
 
 
222 aa  144  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  0.728232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2986  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.17 
 
 
229 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0736686  normal  0.383268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.34 
 
 
176 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  44.38 
 
 
270 aa  141  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1825  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1439  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0487171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0417  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1065  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.331293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1294  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1303  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0733  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1134  NADH dehydrogenase subunit E  46.25 
 
 
161 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0930546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  43.59 
 
 
273 aa  140  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2561  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  45.45 
 
 
175 aa  140  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  47.26 
 
 
174 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  46.53 
 
 
260 aa  139  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  47.26 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  42.21 
 
 
305 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  42.21 
 
 
317 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  42.28 
 
 
155 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  43.51 
 
 
157 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1966  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.59 
 
 
166 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0931539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1032  NADH dehydrogenase subunit E  44.38 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0249192  normal  0.0947418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1081  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.64 
 
 
412 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.320932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1210  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.64 
 
 
412 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.64 
 
 
385 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  41.94 
 
 
168 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  41.94 
 
 
168 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  42.28 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  41.29 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  43.12 
 
 
161 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1746  NADH dehydrogenase subunit E  42.04 
 
 
159 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0990  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  47.55 
 
 
168 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  43.12 
 
 
161 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  43.12 
 
 
161 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
167 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.03 
 
 
412 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.735537  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2395  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.12 
 
 
222 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0717093  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  40.65 
 
 
167 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  42.55 
 
 
230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.97 
 
 
163 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  44.38 
 
 
161 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0821  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  45.45 
 
 
164 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.452585  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.97 
 
 
163 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1347  NADH dehydrogenase subunit E  43.12 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00701728  normal  0.0175389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  43.75 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  39.31 
 
 
253 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  42.5 
 
 
161 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  42.5 
 
 
161 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  42.5 
 
 
161 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2922  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.38 
 
 
264 aa  133  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  40.48 
 
 
239 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1313  NADH dehydrogenase subunit E  41.4 
 
 
402 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0324148  normal  0.032376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4355  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.96 
 
 
171 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4200  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.96 
 
 
171 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.96 
 
 
171 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  44.59 
 
 
174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.78 
 
 
228 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0806  NADH dehydrogenase subunit E  42.95 
 
 
237 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0801  NADH dehydrogenase subunit E  42.95 
 
 
237 aa  130  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01291  NADH dehydrogenase subunit E  44.44 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1761  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.82 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3332  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.65 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103945  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4394  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.95 
 
 
394 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0746  NADH dehydrogenase subunit E  39.88 
 
 
398 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.331264  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.92 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1176  NADH dehydrogenase subunit E  39.63 
 
 
395 aa  128  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  41.03 
 
 
263 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  43.42 
 
 
287 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2831  NADH dehydrogenase subunit E  38.55 
 
 
228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147014  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.29 
 
 
294 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4629  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.16 
 
 
229 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2056  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.21 
 
 
457 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.05 
 
 
188 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  41.25 
 
 
231 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3222  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.24 
 
 
208 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.237944  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1178  NADH dehydrogenase subunit E  39.38 
 
 
303 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.1 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2246  NADH dehydrogenase subunit E  38.75 
 
 
239 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0214593  normal  0.111261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>